Doshisha University
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神学研究科（Graduate School of Theology）
同志社大学神学研究科成立于建校之初，在日本同类学校中历史最为悠久。1920年大学法颁布直到1948的该法的修改，神学科一直所属于文学院。在这期间，学院培养了大批的基督教神父、教父和社会工作者。学院还就一神教，如犹太教、基督教和伊斯兰教等相关的学科进行大量研究和学习。
神学专攻（Theology）
圣书神学研究
历史神学研究
组织神学研究
实践神学研究
一神教学际研究
文学研究科（Graduate School of Letters）
文学研究科于2005年4月进行了改组重编，分成两个独立的研究科：文学研究科和社会学研究科。文学研究科有六个主要专攻：哲学、英文·英语学、文化史学、心理学、日本文学以及美学艺术学。
哲学专攻（Philosophy）
英语、英文专攻（English Literature and English）
文化史学专攻（Cultural History）
日本文学专攻（Japanese Literature）
艺术美学专攻（Aesthetics and Art Theory）
社会学研究科（Graduate School of Social Studies）
社会福祉学专攻（Social Welfare）
传媒学专攻（Media Studies）
教育学专攻（Education）
社会学专攻（Sociology）
产业关系学专攻（Industrial Relations）
法学研究科（Graduate School of Law）
法学研究科的历史最早可以追溯到1891年成立的同志社政法学校。1912年，日本文部省特批该校为“同志社大学经济学院（后改为法学院）”。1920年，新的大学法颁布后，该学院分为两个学科：学科和经济学科。大学法于1948年修订后，两个系分别发展为法律学院和经济学院。1954年学院开设了夜校班。1950年设立了学专攻、私法学专攻、公共法学专攻的硕士课程，1953年增加了学专攻、私法学专攻的博士课程，公共法于1975年设立博士生点。法学院·法学研究科旨在培养学生法律和的分析技能和知识，使他们能理解当今国际环境下的法律和问题。
学专攻（Political Science）
私法学专攻（Private Law）
公法学专攻（Public Law）
经济学研究科（Graduate School of Economics）
经济学院的教育旨在使学生熟悉现代社会经济的方方面面，并掌握一些分析经济问题的技巧。教学课程设计的目的是使学生掌握推动经济发展和应对变化的能力。研究科的教学目的主要是为了使学生毕业后能成为经济分析专家或经济学家。同时，学生也能获得成为大学教师或经济实业家所需的基础知识和技巧。
理论经济学专攻（Economic Theory）
理论分析课程
经济学、经济史课程
应用经济学专攻（Applied Economics）
应用经济学课程
创造经济学课程
商学研究科（Graduate School of Commerce）
商学院前身为京都岩仓所设立的同志社专科学校高等商业部（后改称同志社经济专科学校），于1922年成立。1949年，该学院在同志社大学的重组中发展为商学院，大大增强了师资力量，丰富了图书资源和研究器材，同时还成立了研究生院的硕士点，后来又发展设立了博士点。长期以来，学院培养出大批的毕业生，并在日本各地商业中崭露头角，做出了杰出贡献。作为学术项目的组成部分，学院学生在大三到大四期间必须加入某个指定的或普通的课题组。该课题无论是由一人完成或合作达成，加入课题组都能帮助学生提高研究水平，顺利地完成论文。
商学专攻（Commerce）
综合政策科学研究科（Graduate School of Policy and Management）
综合政策科学研究科作为同志社大学的研究生院研究科于1995年成立。该研究科的目标是采用“政策”这一理念将新学科与传统学科联系起来，同时促进通过教育和研究当今社会问题的解决方法来建立一门新的学科。
研究科设四门特别的课程；公共政策课、企业政策课、人类安全研究课以及技术革新经营课（只限于博士课程）。这些课程旨在培养具备高水平专项知识和综合能力的专业人才，他们将在政府或企业的政策制定或政策实施等方面发挥主导作用。
综合政策科学硕士专攻（Policy and Management）
政策研究课程
社会创新课程
文化情报学研究科（Graduate School of Culture and Information Science）
文化信息学院开设于2005年4月。该学院旨在教育天资聪颖而且雄心勃勃的学生，他们视野开阔而且能够积极投身到国际社会中。
其教育计划目标在于运用数据科学理念分析方法，让学生理解文化的重要意义。其课程注重跨学科的方法，以信息科学技术将人文领域的传统研究贯穿一起。我们热切期待这种组合式手段带来一个全新的学科，并将成为最适合在21世纪取得学术成就的学科。
文化情报学专攻（Culture and Inforation Science）
文化资源课程
语言科学课程
行为科学课程
数据科学基础课程
理工学研究科（Graduate School of Science and Engineering）
同志社于1890年在Harris理化学校开始推行自然科学教育。Harris理化学校由曾在Amherst大学学习自然科学的新岛创办，他相信民族要昌盛就必须推广科学技术。1944年理化学校再度成立并改编为同志社工业专门学校， 1949年经过重组而被建立成同志社大学工学院。
情报工学专攻（Knowledge Engineering and Computer Sciences）
电气电子工学专攻（Electrical Engineering）
机械工学专攻（Mechanical Engineering）
应用化学专攻（Applied Chemistry）
数理环境科学专攻（Science of Environment and Mathematical Modeling）
生命医科学研究科（Graduate School of Life and Medical Sciences）
随着社会对医疗与健康的关注不断增强，对在广泛的领域拥有高度的知识和技术的人才的需求也不断增加。为了满足这样的社会需求，生命医学研究科立志于发现人体好的机能，从工学和医学两方面的视点创造出对社会有用的新技术。
生命医科学专攻（Life and Medical Sciences）
运动健康科学研究科（Graduate School of Health & Sports Science）
在本研究科可以系统地学习将相关诸多学科的前沿发现、健康与运动有机结合的运动健康科学。培养具有自主性和开阔的视野并能够将学习成果应用于现实的专业人员，和能够开拓新的研究领域的优秀研究者是本研究科的目标。
运动健康科学专攻（Health and Sports Science）
心理学研究科（Graduate School of Psychology）
心理学研究科以培养学生系统地学习和研究以重视对人们行为的实证研究的实验心理学为基础的高度的知识和技术的能力为目标，开展并不偏重于基础研究或临床实践某一领域的全面教育。旨在培养具有能发现并预防多种现代社会的社会问题的高度的知识和技能、有助于培养人们健全的心理的人才。
心理学专攻（Psychology）
心理学
临床心理学
全球化研究研究科（Graduate School of Global Studies）
本研究科旨在培养在如今多样化的现代社会及国际社会中，能有效地利用多学科的综合能力的高度从业者、教育者及研究者。
国际研究专攻（Global Studies）
美国研究课程
现代亚洲研究课程
国际化社会研究课程
脑科学研究科（Graduate School of Brain Science）
脑科学专攻（Brain Development and Aging [Integrated Doctoral Program]）
