南通大学是2004年5月经批准，由南通医学院、南通工学院、南通师范学院合并组建而成的省属综合性大学，坐落于长江三角洲极具经济活力并有“中国近代第一城”美誉的秀丽江城 —— 南通。
南通医学院、南通工学院的前身分别是私立南通医学专门学校和南通纺织专门学校，由近代著名实业家、教育家、清末状元张謇先生于1912年创办，是国人最早独立创办的高等医学和纺织院校之一。
学校是1981年批准的首批具有硕士学位授予权的单位，2003年被批准为联合培养博士生单位，是2007年本科教学工作水平评估优秀单位。
学校设有 20个学院，1个独立学院和1个继续教育学院，拥有1所近百年历史的大型综合性三级甲等附属医院；设有78个本科专业，涵盖文学、理学、工学、医学、教育学、经济学、法学、历史学、管理学等九大学科门类。拥有 1 个联合培养博士点、43个硕士学位授权点；拥有1个省高校国家重点学科培育建设点，1个省一级学科重点学科、6个省重点学科，3个省医学重点学科、10个省临床医学重点专科；有3个国家特色专业建设点，5个省级特色专业，5个省级品牌专业建设点，6个省级特色专业建设点，4个省高校基础课实验教学示范中心；有1个省部共建重点实验室、1个省高校国家重点实验室培育建设点、1个江苏省临床医学中心、3个省(部)级重点实验室；有1个省级公共技术服务平台、1个省级工程中心。现有全日制在校生3.2万余人，其中博硕士研究生 1075人，留学生240人。
学校近2000人的专任教师中，高职800多人，博硕士生导师400多人，双聘院士4人。有国家有突出贡献的中青年专家1人，享受政府特殊津贴人员35人，国家杰出青年科学基金获得者1人，优秀骨干教师2人，新世纪优秀人才1人；江苏省有突出贡献的中青年专家6人，江苏省“333工程”培养对象51人次，江苏省高校“青蓝工程”培养对象87人次，江苏省“六大人才高峰”项目资助对象20人次，江苏省高校教学名师2人；江苏省高校优秀学科梯队5个，江苏省优秀教学团队1个，江苏省高校优秀科技创新团队2个。2004年以来，学校承担国家973计划、863计划、国家自然科学基金等国家、省部级科研项目130余项，出版学术专著80部，发表论文被SCI、EI、ISTP 三大检索系统收录743篇，被CSSCI收录340篇。获国家发明专利25项，获市厅级以上奖励290余项。
学校现有4个校区，占地2700余亩，校园建筑面积81.42万平方米。教学科研仪器设备总值3.99亿元，馆藏图书192万册，中外文期刊23797种，中外文数据库40个，配有中英文光盘检索系统，设有“中国国家知识基础设施工程”(CNKI)知识网络一级管理服务中心。
学校与英、美、德、加、澳、日、韩等国的高校和科研院所广泛开展学术交流与合作，与美国、英国、澳大利亚等国高校合作办学。
学校重视党的建设、精神文明建设和大学文化建设，是全国精神文明建设先进单位、全国精神文明建设典型“莫文隋”精神的发源地、江苏省文明单位、江苏省文明学校、江苏高校思想教育先进集体、全国大中专学生志愿者暑期“三下乡”社会实践活动先进单位。
学校秉持“祈通中西、力求精进”的校训，立足南通，服务江苏，面向全国，为经济建设和社会发展提供有力的人才支持、智力支撑和知识贡献，努力推进科学发展，建设高水平、有特色的地方综合性大学。