南沙第二中学创办于1965年， 原名板头中学，位于广州市南沙集贤大街，为村办初级中学。1989年，与原工农中学合并。1999年异地选址重建，次年迁入现址南沙街道金蕉大道东，更名为番禺区南沙二中，为街办初级中学。2006年9月开办高中，更名为广州市南沙二中，成为南沙区直属市一级完全中学。