南京市第三初级中学是一所百年老校，是江苏省现代化示范初中。学校教育现代化和信息化水平高。各班配备多媒体教学系统，拥有网络教室、两个大型报告厅（曾公祠处）、200米塑胶运动场和江苏“省级标准化”理、化、生等科学实验室，电子图书馆，实验器材整洁齐全。2005年学校校园网被评为白下区首届“十佳 校园网站”。2012年顺利完成南京市数字化校园评估。
2004年被市教育局评为市德育先进学校，省级现代化示范初中教学质量优质学校，05年评为市先进单位，07年被推荐为“江苏省文明学校”（已公示）。
学校积极推行素质教育，优化课程结构，大力推进课程改革，积极开展综合实践活动，学校常年聘请外籍教师授课，强化学生英语口语能力，学生综合素质逐步提高，参加各类竞赛成绩斐然。据不完全统计，2013年以来有300多人次在参加全国、省、市、区各类竞赛中获奖。
