石河子大学设有师范学院、兵团教育学院、政法学院、体育学院、文学艺术学院、外国语学院、理学院、生命科学学院、化学化工学院、信息科学与技术学院、机械电气工程学院、水利建筑工程学院、食品学院、农学院、动物科技学院、医学院、药学院、经济与管理学院、商学院、科技学院、继续教育学院、高等职业技术学院等学院。
