美国胚胎学家，遗传学家。生于美国肯塔基州的列克星敦，卒于加利福尼亚州的帕萨迪纳。在大学时主修动物学，并于1886年获肯塔基州立学院理学士学位，1890年获美国约翰霍普金斯大学哲学博士学位，1904～1928年在哥伦比亚大学任实验动物学教授。1928年至加州理工学院筹建生物学系，并在该系任教直至逝世为止。
他早年受德国生理学家J.勒布影响，曾和德国胚胎学家H.A.E.德里施合作从事实验胚胎学方面的研究工作；许多年的夏天都在马萨诸塞州的伍兹霍尔海洋生物实验室工作，并曾4次到意大利那不勒斯的海洋动物学实验站工作。在他从事果蝇的遗传学研究以前，虽然他认为染色体和遗传不无关系，可是到1909年为止他始终怀疑染色体上存在着遗传因子。1909年他发现了果蝇的第一个突变型白眼，过后证实了白眼基因位在X染色体上。接着发现了更多的性连锁基因，这就使他设想基因排列在染色体上。在哥伦比亚大学任教期间，他和研究生及助手们共同发展了遗传的染色体学说，其中A.H.斯特蒂文特、C.B.布里奇斯和H.J.马勒尤其占有重要的位置；他的夫人L.V.S.摩尔根也参加了研究工作并有一定的贡献。人们将他们工作的实验室称为“蝇室”。
摩尔根曾经对于多种生物（包括许多种海洋生物）和生物学问题进行过研究；他的著作也涉及生物学中几个重要的领域，在进化论方面有《进化和适应》（1903）、《进化理论的评论》（1916）；1925年修订后改名《遗传与进化》；在遗传学方面有《遗传和性别》（1913）、《孟德尔式遗传学机制》（1915，与A.H.斯特蒂文特，H.J.马勒和C.B.布里奇斯合作）、《基因论》（1926）；胚胎学方面有《青蛙卵的发育：实验胚胎学引论》（1897）、《再生》（1901）、《实验动物学》（1907）、《实验胚胎学》（1927）、《胚胎学和遗传学》（1934）等。
1928年他接受加州理工学院的聘请，实现了他的理想──建立一个致力于实验的和定量的生物学研究的新型学术机构，同时在滨海科罗纳地方建立了海滨实验室，作为加州理工学院的生物学的训练基地之一。
由于他发现了果蝇的遗传机制，在1933年获得诺贝尔生理学或医学奖；他是英国皇家学会的国外会员，他在1939年获得该学会的科普利（Copley）奖；1927～1931年间他是美国科学院的主席；1930年为美国科学促进联合会主席；1932年当选为第六届国际遗传学会主席；从1897至1945年为止他也是伍兹霍尔海洋实验室的理事之一。